Index: modules/generic_stage_target.py
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--- modules/generic_stage_target.py	(revision 1212)
+++ modules/generic_stage_target.py	(working copy)
@@ -1358,6 +1358,9 @@
 		   		os.makedirs(myemp,0755)
 				os.chown(myemp,mystat[ST_UID],mystat[ST_GID])
 				os.chmod(myemp,mystat[ST_MODE])
+		myemp=self.settings["chroot_path"]+"/tmp/.clst_portage"
+		if os.path.isfile(myemp):
+			os.unlink(myemp)
 
 	def gen_digest_file(self,file):
 		if os.path.exists(file+".DIGESTS"):